Керівництво
| Директор |
| Заступник директора, керівник випробувального центру |
| Заступник директора з санітарно-гігієнічних питань |
Відділ діловодства, контролю та інформаційно-комунікаційної роботи
Відділ неінфекційних хвороб та організації санітарно-гігієнічних досліджень
| Санітарно-гігієнічна лабораторія |
| Лабораторія радіологічних досліджень та інших фізичних факторів |
Відділ інфекційних хвороб та організації епідеміологічних досліджень
| Відділення дезінфектології |
| Бактеріологічна лабораторія |
| Вірусологічна лабораторія |
| Лабораторія особливо небезпечних інфекцій |
| Паразитологічна лабораторія |
Відділ бухгалтерського обліку
Адміністративний відділ
Господарський відділ
Відокремлені структурні підрозділи
| Вараський міськрайонний відділ |
| Володимирецьке районне лабораторне відділення |
| Дубенський міськрайонний відділ |
| Дубровицький міжрайонний відділ |
| Зарічненське районне лабораторне відділення |
| Костопільський міжрайонний відділ |
| Березнівське районне лабораторне відділення |
| Млинівський міжрайонний відділ |
| Радивилівське районне лабораторне відділення |
| Острозький міжрайонний відділ |
| Гощанське районне лабораторне відділення |
| Корецьке районне лабораторне відділення |
| Рівненський міжрайонний відділ |
| Здолбунівське районне лабораторне відділення |
| Сарненський міжрайонний відділ |
| Рокитнівське районне лабораторне відділення |